Docentes a cargo:

Mag. Laura Angelone, Dra. Flavia Krsticevic y Prof. Alfonso Pons.

Objetivos:

 Introducir y guiar a los estudiantes en la lógica del diseño de bases de datos relacionales orientadas al desarrollo de aplicaciones bioinformáticas que permitan analizar, almacenar y gestionar datos genómicos in silico.

Destinado a:

Ingenieros Agrónomos, Licenciados en Biotecnología, Genética, Biología, Estadística, Informática, Matemáticas, Médicos, Médicos Veterinarios, Bioquímicos, Ingenieros en Sistemas u otros profesionales afines que estén interesados en Bioinformática.

Contenidos:

Temario teórico: 1. Bases de datos: aspectos generales, definición. 2. Sistemas Gestores de Bases de Datos (SGBD). 3. Modelos de datos: abstracción, esquemas y estados. 4. Arquitectura de tres niveles: interno, conceptual y externo. 5. Lenguajes de Bases de Datos: DDL, DML, lenguaje de consulta SQL, lenguaje anfitrión PHP. 6. El Modelo Relacional: Conceptos: entidad, tupla, atributo, relación, dominio, esquema de relación. 7. Restricciones del Modelo Relacional: Restricciones de clave, Restricciones de integridad de entidades, Restricciones de integridad referencial. 8. Operaciones: de Actualización: insertar, eliminar, modificar, de Selección: proyección, reunión, unión, intersección, diferencia.. 9. Normalización de datos en el modelo relacional. Concepto. Tipos de atributos. Formas Normales. 10. Estudio de casos. Estructura de bases de datos de bioinformática. 11. Bases de datos SQL. Diseño de BD relacionales. Introducción a los servidores. de datos. Servidores de Disco remoto (SMB y NFS). Servidores de FTP. Servidores de Bases de Datos (MySQL, Postgres). Hacia la integración semántica. Resolución de problemas y manejo de programas informáticos específicos. Práctica – Laboratorio: Temario: Sistemas Gestores de Bases de Datos (SGBD). Instalación de WAMP (Windows, Apache, MySQL y PHP), Instalación de paquetes en Linux. MySQL: consola de comandos, gestor phpMyAdmin. Tipos de datos MySQL. Prácticas: Práctica 1: Consultas SQL DDL Práctica 2: Consultas SQL DML. Práctica 3: El modelo Relacional. Definición de Claves PK, FK, indexación. Búsqueda, Búsqueda de patrones. Funciones de agrupamiento. Reunir tablas (join). Exportar e importar datos .xls .csv .zip. Práctica 4: Lenguaje anfitrión PHP. Conexión con MySQL. Diseñar y ejecutar consultas. Formatear y mostrar datos. Practica 5: Analizando las estructuras e interfaz de usuario de bases de datos genómicas actuales.

Forma de evaluación:

Asistencia al 75 % de las clases. Aprobación del Trabajo práctico con un mínimo de 6 puntos sobre 10.

Informes e inscripción:

Escuela de Graduados - Facultad de Ciencias Agrarias – UNR, Campo Experimental Villarino, C.C. 14 (S2125ZAA) Zavalla - Santa Fe, Tel: +54 341 -4970389 – 4970080. Esta dirección de correo electrónico está siendo protegida contra los robots de spam. Necesita tener JavaScript habilitado para poder verlo.

Carga horaria: 40 hs

Arancel: $ 1400 (Becarios de Agencia, CONICET e INTA cuentan con el 50% de descuento)